La communauté médicale reconnaît que TSS est causée par la bactérie Staphylococcus et Streptococcus, mais au-delà de cette cause, il est encore mystère entourant la cause de TSS. La simple présence de la bactérie est pas assez pour causer TSS. Par exemple, les bactéries se trouve souvent dans les zones génitales des femmes en bonne santé. Dans d'autres, les bactéries se trouve sur la peau, où il est tout aussi inoffensif. Pour que les bactéries de causer un dommage, une prolifération des bactéries doit être présent dans la circulation sanguine, qui à son tour libérer une multitude de toxines qui pèsent sur l'ensemble du corps. Cela va causer des vomissements, de la fièvre et, dans les cas extrêmes, la mort. La mort survient de TSS lorsque le cœur et les poumons sont accablés par les toxines au-delà de leur capacité de fonctionner.