Chimiques ou biologiques fongicides tuent soit un type spécifique de l'agent pathogène ou une large gamme de pathogènes du sol. Le méfénoxam fongicide chimique, par exemple, tue le Pythium et Phytophthora champignons pathogènes, mais ne sont pas efficaces contre d'autres pathogènes du sol. PCNB, également appelé quintozène, est efficace contre un certain nombre de champignons, y compris Sclerotium rolfsii, ce qui provoque la flétrissure sud.
Fongicides biologiques sont des champignons telluriques et qui éliminent les champignons nuisibles. Gliocladium virens contrôles champignons Pythium et Rhizoctonia causant la maladie, tandis que le champignon Trichoderma harzianum tue Rhizoctonia.