L'aspect le plus critique de l'application de PCSX2 est la mise en œuvre du fichier BIOS approprié. Le fichier du BIOS détermine le type de logiciel spécifique qui peut être lu par l'application. Jeux PlayStation 2 sont affectés avec des codes de région, assurant ainsi que les consoles de certaines régions ne peuvent jouer un logiciel destiné à cette région. Il ya cinq options de configuration du BIOS disponibles dans le menu de sélection des composants. Avant de jouer à un jeu avec PCSX2, vous devez d'abord activer le fichier BIOS correct qui correspond à la région de logiciel désiré.