En plus de déplacer l'oxygène et le dioxyde de carbone, l'ectoderme élimine les déchets de l'anémone. Les déchets solides, y compris les objets non comestibles tels que les petites roches, sont éjectés sortir de la bouche cavity- mais l'anémone n'a pas de système excréteur, il libère des déchets après digestion par diffusion. Habituellement, ces déchets est sous la forme d'ammoniac libéré dans l'eau de mer.