Écoles qui ne parviennent pas une accréditation globale - ou ceux qui combinent très différents programmes de formation professionnelle - peuvent opter pour une accréditation de programme individuel. Ces types d'accréditation sont traitées par les conseils d'administration de la formation professionnelle des futurs travailleurs dans le domaine, plutôt que par les commissions d'accréditation reconnus au niveau national. Par exemple, une école offrant des programmes de formation d'assistance médicale dans une variété de disciplines peut solliciter l'accréditation du Conseil sur l'éducation médicale naturopathique pour sa holistique programme praticien assistant, tout en cherchant en même temps l'accréditation de l'American Veterinary Medical Association pour la reconnaissance de son vétérinaire programme technicien.