L'eau dans laquelle les plantes hydroponiques poussent ou qui passe sur les racines des plantes doivent contenir des nutriments appropriés pour assurer les plantes sont en bonne santé. Mélanges commerciaux contenant des nutriments importants tels que l'azote, le phosphore, le potassium, le calcium, le magnésium et le soufre sont disponibles dans les magasins de jardinage. Ces préparations comprennent souvent aussi des oligo-éléments tels que le fer, le manganèse, le bore, le molybdène, le zinc, le cuivre et le chlore - tout le nécessaire pour la croissance des plantes en bonne santé. Exprimée en parties par million (ppm), la quantité du mélange ajouté à un système hydroponique dépend de ce qui se développe dans ce système. Les plants de tomates et poivre, par exemple, ont besoin de 1.200 à 1.500 ppm au cours de leur stade de la floraison et de 500 à 700 ppm lorsque leurs fruits sont de plus en plus.