Comme cela est le cas lors de l'utilisation de tout instrument scientifique, vous devez vous assurer que l'appareil est en bon état de fonctionnement avant de l'utiliser pour analyser un échantillon. Vérification de la réponse de l'instrument pour un échantillon connu vérifie que l'instrument est correctement calibré. Spectrophotomètres nécessitent un étalonnage périodique pour assurer une réponse correcte de l'instrument. Infrarouge (IR) spectrophotomètres utilisent polystyrène comme étalon. Un balayage de l'instrument avec un morceau de polystyrène dans le porte-échantillon doit vérifier la présence de pics observés sur les spectres IR et l'intensité relative des pics.