Software for Microbiology

Outils de visualisation

• Une image physique ou mentale des données brutes que vous recueillez peut vous aider à mieux appréhender sa qualité, signification et les implications. Open source et les logiciels de visualisation de données commerciale est largement disponible pour la recherche de la microbiologie. Créer des diagrammes et des graphiques de vos données en utilisant LibreOffice Calc, Excel de Microsoft ou le système de visualisation des données Mondrian. Applications rasmol Cell-O et vous aider à créer des modèles 2D et 3D animés de molécules biologiquement importantes comme les protéines et les acides aminés.

Modélisation mathématique

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  Les grandes collections de données de microbiologie donnent souvent des renseignements plus utiles une fois qu'ils ont été analysés numériquement. Logiciels MATLAB, Octave et SciPy qui effectuent raffinement mathématique, l'analyse et la modélisation des données des scientifiques. Utilisez ces paquets pour faire estimer le paramètre par ajustement de la courbe, les prévisions épidémiologiques, les simulations de la croissance bactérienne et le bruit de données ou stochastique élimination de l'effet. Ces applications aussi effectuer des calculs statistiques, comme l'analyse de la variance ou de tests du chi carré.

Genome Bioinformatics

• Applications logicielles de microbiologie également vous aider à visualiser et information sur les mines de la séquence d'acides nucléiques qui composent l'ADN d'un micro-organisme. La Fondation Open Bioinformatics fournit, open-source séquençage et l'analyse de l'ADN des applications gratuites comme BioJava et Biopython qui extraient les données des banques d'information du génome, analyser le code ADN d'un organisme et de le comparer à d'autres échantillons d'ADN. Progiciels d'analyse du génome inclut Relief, HMMER, Clustal Omega, phylogénie Inference Package, ou PHYLIP, et la manipulation Suite de séquence, ou par SMS.

Référence du logiciel

• Le rythme rapide de la découverte scientifique en microbiologie et l'évolution des règlements gouvernementaux, il est essentiel que les microbiologistes ont facilement accès à l'information que les impacts de leur travail. Hugo est un logiciel commercial qui fournit des microbiologistes des renseignements à jour sur les outils, les produits chimiques, les équipements, les milieux de culture, les exigences de sécurité, de nouveaux organismes, les changements taxonomiques et des antibiotiques. En outre, les microbiologistes travaillant dans la science des aliments peuvent utiliser l'application Web Browser ComBase pour accéder aux données microbiologiques liés aux aliments fournis par des organismes gouvernementaux au Royaume-Uni, l'Australie et les États-Unis.