Le protocole de qualification d'installation vérifie que chaque pièce d'équipement a été correctement installé et configuré pour sa tâche assignée. Le QI évalue également si les procédures d'utilisation de l'équipement ont été approuvées, si l'équipement dispose de tous les manuels d'exploitation et de la documentation disponible, et si le personnel d'exploitation de l'équipement ont été formés à son utilisation correcte et sûre. Le QI détermine également si les conditions environnementales, comme la température, la ventilation et l'humidité, sont adaptés pour faire fonctionner l'équipement.