Bateaux RC utilisent généralement des radios à deux canaux qui sont conçus pour les bateaux au sol, comme un bateau ou en voiture RC. Ces radios utilisent une gamme de fréquence différente de celle des systèmes aéroportés. Il est sage de ne pas utiliser un système aéroporté à deux canaux dans un bateau RC. En effet, dans un bateau RC, un canal, habituellement dicté par la manche gauche, est utilisé pour le gaz, et le bâton de droite commande le servo de direction. La plupart des bateaux RC utilisent un système d'entraînement par engrenage pour aider le moteur à générer plus poussée. Bateaux à propulsion électrique devraient toujours être équipés d'une commande d'accélérateur qui permet au bateau de se déplacer dans le sens inverse. Dans le cas d'un voilier, le servo de gaz est généralement remplacé par un asservissement du treuil voile. Cela permet à l'opérateur de couper le voile que le vent tourne, comme un vrai bateau à voile.
Le logement de la radio du bateau doit être étanche à l'eau pour protéger les composants électroniques à l'intérieur. Les joints en caoutchouc sont installés sur l'arbre d'hélice de bateaux à moteur pour empêcher l'eau de pénétrer dans la coque.