En dépit de la prévention encore plus la pollution provenant de la combustion de carburant, des oxygénateurs comme MTBE sont dangereux pour l'environnement. MTBE, par exemple, est soluble dans l'eau. L'Environmental Protection Agency (EPA) note, "Un nombre croissant d'études ont détecté du MTBE dans les eaux souterraines à travers le pays- dans certains cas, ces eaux contaminées sont des sources d'eau potable." Pas tous les oxygénateurs avoir les mêmes dangers environnementaux, mais ils ont tous eux.